“厘清”中的厘是极小的数量，清是清楚，两者合起来表示从最细小的方面都搞得条条有序清清楚楚了，因此可以引申出整理清楚的意思。而"理清"一般用于有条理的事物。

用法不同

厘清主要用于划清界线，区分不同，使得某问题或现象的性质等分明地呈现出来；理清主要用于理清思路、头绪。

词性不同

“厘”作动词用，有“整理、治理”的意思，厘清带有文言文色彩，如“厘正”、“厘定”等次，它支配对象往往是“关系” “原则” “任务 ”等。而“理清”虽然可以做动词也可以做名词，但在大多数情况下，是做名词使用。

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